Construction efficace de la surface de systèmes moléculaires complexes sur GPU - Laboratoire Génomique, bioinformatique et chimie moléculaire
Communication Dans Un Congrès Année : 2023

Construction efficace de la surface de systèmes moléculaires complexes sur GPU

Cyprien Plateau--Holleville
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1397537
Maxime Maria
Stéphane Mérillou

Résumé

La surface exclue au solvant est une représentation moléculaire intéressante dans un cadre de visualisation grâce à sa capacité à illustrer les potentielles interactions. Son calcul reste cependant difficile en raison de la complexité de sa définition géométrique, mais aussi de la difficulté à paralléliser les opérations requises. Dans cet article, nous présentons une méthode de génération de cette surface, basée sur une récente analyse mathématique, permettant de s'affranchir des limitations précédentes, notamment grâce à des traitements GPU adaptés.
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Dates et versions

hal-04633888 , version 1 (03-07-2024)

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Identifiants

  • HAL Id : hal-04633888 , version 1

Citer

Cyprien Plateau--Holleville, Matthieu Montes, Maxime Maria, Stéphane Mérillou. Construction efficace de la surface de systèmes moléculaires complexes sur GPU. J.FIG 2023 - Journées Françaises de l'Informatique Graphique, Nov 2023, Montpellier, France. ⟨hal-04633888⟩
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