Depuis l'émersion de la plate-forme carbonatée du bassin du Sud-Est de la France à l'époque de l'Albien-Cénomanien, un long processus de karstification complexe et polyphasé se met en place, sous les contraintes conjointes de la tectonique, de l'eustatisme et du climat. Le bassin endoréique d'Issirac comprend des terrains allant du Crétacé à l'Éocène. Connecté au sillon d'Alès, il a été soumis à des variations eustatiques combinées à des écoulements provenant à la fois des Cévennes et vraisemblablement de l'endokarst en cours d'édification dans la plate-forme carbonatée régionale qui englobe le plateau de Méjannes-le-Clap, situé au nord du département du Gard, et l'interfluve Cèze-Ardèche. Une karstogenèse s'instaure au Crétacé supérieur et au début du Paléogène. Elle est liée à l'installation d'un bassin et la formation d'une surface d'aplanissement où se déposent des sédiments remaniés dont il ne reste à ce jour que des reliquats. Peu visible au niveau des formations du Paléocène et de l'Éocène du bassin d'Issirac, la karstogenèse laisse entrevoir dans les assises calcaires du Barrémien supérieur et de l'Aptien (Bédoulien), des indices de creusement dont les remplissages contiennent en forte proportion des altérites présentant de minéraux d'origine volcanique ou magmatique en provenance du Massif Central. L'élaboration d'aquifères karstiques oriente des écoulements hypogés dirigés en premier lieu vers les niveaux de base successifs s'établissant dans le bassin endoréique au cours des mêmes périodes puis leurs accommodations au cours de l'Oligocène et du Miocène. Cette dynamique modèle des nouveaux façonnements endokarstiques de diverses ampleurs. Les dernières observations géologiques in situ mettent en exergue un changement de direction progressif des écoulements hypogés passant ainsi des aggradations sédimentaires du niveau de base constitué par le bassin endoréique d'Issirac à des points bas successifs liés à l'enfoncement des cours d'eau de la Cèze et de l'Ardèche durant l'ère Cénozoïque.